右归丸和金匮肾气丸的组成、功能、主治上是有一些区别的。虽然两个药都是滋补肾阳的方子，但从方子的组成来看，右归丸由熟地黄、附片、肉桂、山药、酒茱萸、菟丝子、鹿角胶、枸杞子、当归、盐杜仲组成，温补肾阳的功效较强，力量较大；而金匮肾气丸是在六味地黄丸的基础上，加上了附子、桂枝、牛膝、车前子，全方偏于柔和，并且补中有泻，是比较平缓的温补肾阳的方子。从功效上来说，右归丸是用来治疗肾阳不足，年老体弱，气衰，腰膝无力，阳痿遗精等症的；金匮肾气丸偏于治疗小便不利，下半身冷痛，水肿，脚气，腰痛乏力的。
金匮肾气丸和右归丸虽同属补肾阳的代表方剂，但因其着眼点并不一样，因而临床应用也有些差别。金匮肾气丸
用干地黄为君，偏于平补，多用于治疗因"肾主水"功能失常而致的水液代谢方面的疾病；
而右归丸改生地为熟地，又用大队补阳药，偏于温补，
多用于治疗因"肾主藏精"功能失常而致的生殖方面的疾病。
金匮肾气丸和右归丸都能够温肾助阳。 金匮肾气丸还能化气行水。用于肾虚水肿，腰膝酸软，小便不利，畏寒肢冷。 右归丸还能填精止遗。用于肾阳不足，命门火衰，腰膝酸冷，精神不振，怯寒畏冷，阳痿遗精，大便溏薄，尿频而清。
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